mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACGAAGGTCTGCATCATAGCC CTATGATGCAGATTCTTCATCT CCTTCCTCTAGCCTATGATGCAGATTCTTCATCTGTTTGTTATCGTTCTCATGGTGTACATAACAGACGAAGGTCTGCATCATAGCCAAGAGGAAG GCAGTTCTCTCTGAGTGGGTGCAGACTTTGTGTTATTGAGGGTTCCAGGTTGCTGGAGTGGGGTCGTTTTGATGTCGTTTACTGCATGACTGGTGATGGGGGTTAGATTTCGTTGATGATTATGTTGGTTGTGATAAATCGGTTCCGTGTCGTCATAATCGCAAGTGTTGCAGGCAGTTATGAGGAGATGGAGAGCGTGCAGACTTGTTTCCTTCCTCTAGCCTATGATGCAGATTCTTCATCTGTTTGTTATCGTTCTCATGGTGTACATAACAGACGAAGGTCTGCATCATAGCCAAGAGGAAGCAAATCTTAATACCTGGCTCGAATTTGGCCTGCACGCAATTTTGCCCCGGTCTGACGCTCTACCTTTANCGAGTTTGCTCGTGGGCTTTGGGGACATCTATTTCTTGTCTACCCCTTCTGACGCTGTTTCAGCCTGGCTAAACCCAAGTACATGGAATAGATCTCTCTTTCTCTCTCTCGCTCTCTCTCACTCCAGCAAGACGATAGATTGATGGAAGTCTCAAATAAATAGAA 3 1 3' arm Physcomitrella_patens mirnest 100 ppt-MIR902b 1e-49 -40.9 .((((((((...(((((((((((((.((((.(((((((((((((((....)))))).))).)))))).)))))))))))))))))...)))))))) (-40.9)