mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGATGCAGATTCTTCATCT ACGAAGGTCTGCATCATAGT TTCCGCTAGTCTATGATGCAGATTCTTCATCTGTTTAGCTGAATCTGCGTCAGTGTTTCAGTGTTACAGACGAAGGTCTGCATCATAGTCAAGAGGA ATCAGTCCGCGTCTCTGTCCACCCTGCGGTCGGGTTCTGCGGACCTAGGTTGTCTGGTGATTGTTGTGGAGTTTGATTGCTGCCGCTGCTGCTGTTGGTCATATGGCTATGTTTCTACGCCGCGCTTTCGGGCTGCTGCACAGTGTATGTGGTGCTCCGATTGCCTCTGGCGGTGAAATATGTATCGCGATCTAGGATCTAGCGTTTGGTGATTGCGGATTTGCACAGACGCACATGCGCTTGTTCCATTCACTGGGTCGTCCTGTTGTGGTGAGCATATCGTGCGGGTGATTGACTGCATGTAACGAAGCCTTGGAGTCTGTGTTGATGATTCCATTGTTGGTGTTTCAGACGCGCTCTAGGTGGTAGCAGGTTTGTTCATTTTCTTCCGCTAGTCTATGATGCAGATTCTTCATCTGTTTAGCTGAATCTGCGTCAGTGTTTCAGTGTTACAGACGAAGGTCTGCATCATAGTCAAGAGGAATGAAAATACATTATAGATTATAGCAGCTCAATTACCAACTTTGTCTAGGAAATCTCAAAAATTAAACCCTTTTTTGATGGTCAAAACTGTTGGGTTTAGAGCACATCCGGTGGCAGGGGTTTAGTTTACGCAGTACATTTGGATCCAGTGAGACTATGTTACCATTTGGTTGCTTCTCCCTTATCCACATTGCGCAAACTAGAAACCAGCAGA 1 1 5' arm Physcomitrella_patens mirnest 100 ppt-MIR902g 3e-50 -40.1 .(((......(((((((((((((.((((.(((((...((((((.(((...)))...))))))...))))).)))))))))))))))))......))) (-40.1)