mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCTTCTCTGTTCCACAGTGA ATGTTGGAAAAGAGATCAGAGTA GGGAAGCAACTTCATGTTGGAAAAGAGATCAGAGTATGCTGGGATAATGGATGCCTGCTCTTCTCTGTTCCACAGTGATATGGGTACT CAAAGCAGTTGAAGATCATATTCTCATGCATTGGACGACACAAGCACGTGAACAGCTGAGAGATGATCGGCAACTAAATGTGAATGCTCAAGATTTTGATACTGGTGATCTTTATGCAATGAAGTTGAGGTGGCGTGGAAGTTATTACAATCTTATTGGCAAATGGGGCAAAATCATTCGAGGGAAGCAACTTCATGTTGGAAAAGAGATCAGAGTATGCTGGGATAATGGATGCCTGCTCTTCTCTGTTCCACAGTGATATGGGTACTCATGATGTATAGCCAAATATTTCACCCGAAAATATATTGGTTAGTTGCTGCCTTTATTTTTTATTTAATTCCTTTGTTCCGCTCGTTTGAGGCCCTGTGTCATGCTTACGGAGGAAGGATTCCAAACTAAAATGGACATGGAGTAACGGAGCTCTGCAGTATCTCTTTGGACTGAAAGATTACCAGCAAACTCGAGTAACAGATAGATATTATAAGTGTCCCAGTTCATAGGCAAGAATGATACCATAGGATCCGTCCACGCGCACAGTCAACAGCCAATTATGTGCATTGGGCAAGCTCACAAATGAATCTAATTGCTGAGCTATTGTCGCTGCCAACTTGACTACAGATTCTATCAATTTGAAAACAAATGAATCTAATTGCATCATAGCTTCTGCGGAGAAAATGTTCTGCTGCTAATGCCACGCTGCTGGTTGTGC 3 2 3' arm Actinidia_chinensis mirnest 100 100 -24 .....((....((((..(((((.(((((..((((((.((.............)).))))))))))).)))))..)))).....))... (-24)