mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTTCCCAATTCCACCCATTC GTGGGTTGGTTGGGAAGAAA CAAGAATTGAGGGAGGTGGGAATGGGAGATTGGAGCTAGCAGAAGTTGTAGGAGTGGGTTGGTTGGGAAGAAATCAAAACCTTATGATATTGTATATGTTATGGTTTTTATTTTTTCCCAATTCCACCCATTCCTATTATTTCTATTGGTTCCTCCCTTTCCTTTCTTCTCTACATCACATCT AGTTGTGAAGTGAAACCAAGCAAGAATTGAGGGAGGTGGGAATGGGAGATTGGAGCTAGCAGAAGTTGTAGGAGTGGGTTGGTTGGGAAGAAATCAAAACCTTATGATATTGTATATGTTATGGTTTTTATTTTTTCCCAATTCCACCCATTCCTATTATTTCTATTGGTTCCTCCCTTTCCTTTCTTCTCTACATCACATCTCTGACTACAGCTAACTTCACCACTTTAATAGAGTACTTTGATTTGATTCGATTTGATTCCCCCTTTTGTGTTCATCAACATTATTATTATTATTATTTACTTGAAAAATATGTTTAGATT 1 1 3' arm Arachis_duranensis mirnest 100 mtr-MIR2118 1.0E-7 -76.6 ...((..(((((((((.(((((.((((....((((((((.((((((.((((((((((((.((((((((((((((.((((((..(((((((.....))))))))))))).))))))))))))))..)))))))))))).)))))).)))))))))))).)))))..))))))).))))...... (-76.6)