mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCACTGCCTCTTCCCTGGCT ACAGGGACGAGGTAGAGCATG TTCATCTTAGGGGTGAGAACTGAGAGGATTGAAAGAGAGTGATGATAAATAAGACAGGGACGAGGTAGAGCATGGATGGAGTTCCCAACAGAACAGTCAAGCTGTTGTGGCTCCACTCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCTTTGACTCCTCTGGATTTTCTTAACCTCTTTTACGTACTCATCCCATTAGT AGATCAATCAGGCTTGACATAACCAAAGCAGATAGGCAAGTCGACCGGTGAGTACTATTCTCGATCGGAGCAGCTGATTCTGTTGGAGGTCAGGTAGAGTTTCACATTACTAGTTCATCTTAGGGGTGAGAACTGAGAGGATTGAAAGAGAGTGATGATAAATAAGACAGGGACGAGGTAGAGCATGGATGGAGTTCCCAACAGAACAGTCAAGCTGTTGTGGCTCCACTCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCTTTGACTCCTCTGGATTTTCTTAACCTCTTTTACGTACTCATCCCATTAGTTTTAAACCCGGAAATGTTCTCTTGCCAGATAGTCTGTTATGATAATGATGATATAATATAAGCTACTTCTGTTTTTTTGGACATGATAGAATACTGCTGCTAATGAACCAGGTTGCTGAACATGTATAGATGATATATTCTTGTTTTAAATTTAAATTGAGGTGTCAGATTCTACATGATGCAATGTCCACATGACTACATTATACTTGTGCTGTATTCATTAATTTTATGATATTATAATCTTACTTGATGATTCTCATCAGATTTGATCATGATTATACATACATATGGAACCATTTATATATAGTTATGGGAATATATACAATAACTTGTATGCTCCTAGTTTCCACCATTCCAATTCCAAGCTATGCAATTGACTGATCAAGATTCGAAAGCATGCACATTAACAGTCTAACAGCAGATGGATCTGGAAAAGTATCATTGATTCATTGGATGATGAAATCATGAAGGTCCAATTTCCAACCACAATCGTCTGTCTTTAAAATGGGAATTGGTCAAGACCTTATCAGGATTTGATAGCCTGGCTTACATGTAGCAACATAAGATTCAAGATTAGGCATTGTAAAATATACATTTCTGTCATTTGATCATTTCAGTAGTTTCTTCTACATGCTTTT 3 0 3' arm Fragaria_vesca mirnest MIR408 0.00000000000001 vvi-MIR408 0.000000003 -70.6 .........((((((((.((.((((((...(((((((((.((........(((.((((((.(((((((.((((((.(((((((..((((((..........)))))).))))))).)))))).))))))).)))))).)))....))))))...)))))....))))))....)).))))))))...... (-70.6)