mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTGTTGCCGGGAACGGCGTC TGCTGTGAACTCGGTGGCT TCCCCACGCTCAAATCGTCGATTTCTTCGACCTTGTTGCCGGGAACGGCGTCGGAGCTGTACTCGCCACCATGCTAGTCGCCGACGACGGCTCCGGGACGGCCTCTTTACAATGCTCGAGATGCTGTGAACTCGGTGGCT TTGGCGCCTCAAGACCGGCGATCCCCACGCTCAAATCGTCGATTTCTTCGACCTTGTTGCCGGGAACGGCGTCGGAGCTGTACTCGCCACCATGCTAGTCGCCGACGACGGCTCCGGGACGGCCTCTTTACAATGCTCGAGATGCTGTGAACTCGGTGGCT 4 2 5' arm Fragaria_x_ananassa mirnest 100 100 -47.4 ................(((((.....)))))...(((((((((.((((((((.((((.(((...(((.((..(((.((((....)))))))...))...))).....)))...))))..))))))))...))))))))). (-47.4)