mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACCCGTAGATCCGATCTTGT AAGCTCGTCTCTATGGGTCCC CACTTGTCATTAACCCGTAGATCCGATCTTGTGCTACTTAACAACGCAAGCTCGTCTCTATGGGTCCCTGTCTCTG CCACGCGTCCGAATAAATATTATCTAACTGATATTGAATACATGCTTGTCTAACGCTAGCTGGGTCAGACGTACATTTATAGATTTTATTTTATTTTTTTTTTAATGAATGAACTCAAAATATTCTCCATTTTTTTCTTTTGATAGAAATCGAGCGTGCCCCGTCGAGAGCATTTAAGATGGCGGGACGGGGGCGGGGCTTCGAGGCGATGCCAGTTAGAGACAATGCCTGGCGTATTTTTGGAGTAATAACTCGCACTGGCGTATACCGATGTTAAACCGCACAACATACGTGCACACACCCCTGCTGAAAAAATACAATAGAAACCCTGATTGAATTCGTAATGGTTTTAATGGTTTTAATGGGAATTGTATAGGTTTTAATGGAAACTGTAATTGTCCCTGTGGGTCTGTACTGGTAATTTGGAGCCTTCTATGGGTAGCATGTTATGTCTAGCGGTACATGGTACTGGTTTTAATGTCTAGCTGATGGTTTGTAATGGTATTTATAGTGGAAACCATTAGAATTTCTGTGATGGTTTCTATTGGGTATTTTATTTTATTTAATTTTTTTCATTTTTTCACAAGCCTATCTTTATTTAATGTAAATGAATCACTGAGCACAGAACTGACTTCTCTCCTATATCTCTGCCAGTTCTCACTGAGCTTCACGTTTGATCTCTTTGAAACAATTTTATTCGTTTTCATCAATTTTCAAATCTGAAGTCAGTGAGGAGCCACTTGTCATTAACCCGTAGATCCGATCTTGTGCTACTTAACAACGCAAGCTCGTCTCTATGGGTCCCTGTCTCTGTGGTAGACAGCTTCTGGCTCGTGCCTTTGTAATACGTCTTAAACAGTTCATGTATTTTCATTTAGGGGAAGCACCTAGGGTAGGCAAAGACACAAACGGATTTATTT 4 0 5' arm Ictalurus_punctatus mirnest mir-10 0.00000002 dre-mir-99-1 0.000000000004 -20.1 ............(((((((((..(((.((((((...........)))))).)))..)))))))))........... (-20.1)