mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGCTCAGTTCAGCAGGAACAG GTGCCTGCTCTGCTGATAATCAGT GCTGGTCTCCTGTGCCTGCTCTGCTGATAATCAGTGTCTCTCTTCAGCTGGCTCAGTTCAGCAGGAACAGGGGCCTGG ACACTCGTTCACTCACTCACTCACTCACACCCTTGCTCTAACCCCGTCTGGCTCCCAGACACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTCTCTATCTCTCTCTCTGTCTTTCACACACTCGCACACATGGTGTCTGCGAGGCTGCCGGGCGCTCCCTCTGAAGACTCACTGCGATCTCCAGGAGTTTTAGGAAGGGCGAGTGGGAAAAAGTGCAAAAAAAAAAGTAACAGTGTGTTCTGGTGCTCCTTTCTCTCTGGTCTGTATCAGTGGGCTGGTCTCCTGTGCCTGCTCTGCTGATAATCAGTGTCTCTCTTCAGCTGGCTCAGTTCAGCAGGAACAGGGGCCTGGTCTTGCCAACATAACACCTTAGAGACACACATCTACATCCACACACACACATACACACACACACACACACACACACAGATGCACGCCACCAGACGTACATTCTGGGAAAATCCACACTCCCGCACCTTCCACAGCTGGGATCCAGAGCGTGATGGATATATACAGTTGATTTAAGTTATGAATGTGATAATGTGTGATAATAAGACTATAGCCTACCGATTATGGACTGGCGCCGTGACATCAATAAAACTGAGACATC 4 2 3' arm Ictalurus_punctatus mirnest mir-24 7e-17 fru-mir-24-2 2e-17 -32.7 ...((.(((((((.((((((..(((((...(((((...........))))).)))))..)))))).)))))))))... (-32.7)