mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGTACCGTGAGTAATAATGC ATTATTACTTTTGGTACGCGC ATATCACAGCTACTGGCCTGCTTCCCAGCTCATTATTACTTTTGGTACGCGCTAGGCCTGCCTCAAGCTCGTACCGTGAGTAATAATGCACTGTGGCAGGCATTAAGCTACCTGACA ACTGGACGCCTGCGGTCCGGTCCGGATTCCCGGGTCGACCCACGCGTCCGCGGACGCGTGGGCAGCTACAGGCACAGAGCTCACACCAAACATCTCCACACCATGTCTCCAAACCTCCAGCGGCTGTGACGGGACTCTCCACACACTCAGCTCTCCTGCTACACTGGCATCGGACATTAAACAGCTGGAACAGGAGGTCCCTGATCAACTGAGCAGATGAAGGGTGATCTAATATCACAGCTACTGGCCTGCTTCCCAGCTCATTATTACTTTTGGTACGCGCTAGGCCTGCCTCAAGCTCGTACCGTGAGTAATAATGCACTGTGGCAGGCATTAAGCTACCTGACACTGCAGCTACAGCTCTGGAGTCCAGTAAAAGAGGAGCATCGTGAAGACCATCAGTCTGCATTTCACATGTGATTTTTACTCTTTGCATTTGCACTGTATGTAAAAAAAATGTTTAAATGAATGAGTGTGTGAAATGGCAGTTACTGGTGACATTGGAGAAATAGGTTCGAGTGTTGAGACGTATGGCCTGTGGTTTTTCAGGTGACATGTAAAGTGCATTATAATGTGGGGTTTCAGTTCAGTACAGAATCATATGTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTACGTGACAGTATGATGTTAAATTATAAATGTTTTTTATCTACATGCACCTTTGTCTTAATTATATTGGATATTGGGAAATAAGTTTGTATTTTAATAAATATTTAATAATTAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAG 3 0 3' arm Ictalurus_punctatus mirnest mir-126 8e-24 dre-mir-126a 7e-27 -45.2 ...(((.((((....(((((((...(((..(((((((((((.(((((((.((((((....)))..))).))))))).)))))))))))..))).)))))))....))))...))).. (-45.2)