mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTAATCAGCTCAGTAGGCACG TTCCTGCTGAACTGAGCCAG CCAGACTCCTGTTCCTGCTGAACTGAGCCAGTGTTTCTGCAGTACTGTAATCAGCTCAGTAGGCACGGGAGGCCA TAGAGATGGTGCTGACTGATGCTGGTGTGAGGCGCAGTGCCATGTGTATGCTCTTCTCTATGCGTCAGAAACTAAAAGGAGATGGTGCAGTGAATGCCAGGCTCAGGATGCTTGAGGACAGACTCCACACAGCATAGTGCCTCAGGCTGCACATGAACACATGGACTTGCCCAAACGCTGGCATGTGAAAGGTGGTGATTAGCTGTGGTGTCGGGTGCCTGTGTGCCGCTGTCGATTTCCCTGAGCTGATTTCACACTTGGAGGCCAGAGCTTGAAGAGGAGAGCCTGCATCAGTCCTGTTCAAAGAGACAAACAAGTGGATATGGATTTTAAATATGGATCTTTAAAAAAAAAAGTTTACTGACATGGTGGGGGGGTTGGGGGAAAGACTAAAACCTTGTTCTGTAAGTGAAACTTACTCACATAATTCTTTTATCCATTTGGCCTACAATACAAGCCCCATGACTCTGGGTAATGATACTGAATTGCTGTTAGCAAAAAATGTACATTAATGGCATAAATGCCATGAGCATCCCAGCTGGAGCCACTACGTGTCCTCAGTACTTCAACATTGCAGGAGGACGTTGTTGGGTCAGCGGTCTGTAGACCAGACTCCTGTTCCTGCTGAACTGAGCCAGTGTTTCTGCAGTACTGTAATCAGCTCAGTAGGCACGGGAGGCCAGGTCCATTTGGCTCTTGGCTCTCTTTCAACACAGCTTGTAGGAGATCCATACACAAACCGTCAAACGGGACTAATTCACTTCCAC 4 1 3' arm Ictalurus_punctatus mirnest mir-24 2e-23 dre-mir-24-3 5e-30 -31.5 .....(((((((.((((((((.((((..(((((.........)))))...)))).)))))))).))))))).... (-31.5)