mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTTCCTGCTGAACTGAGCCAG GTAATCAGCTCAGTAGGCACGG ACCAGACTCCTGTTCCTGCTGAACTGAGCCAGTGTTTCTGCAGTACTGTAATCAGCTCAGTAGGCACGGGAGGCCAG TAGAGATGGTGCTGACTGATGCTGGTGTGAGGCGCAGTGCCATGTGTATGCTCTTCTCTATGCGTCAGAAACTAAAAGGAGATGGTGCAGTGAATGCCAGGCTCAGGATGCTTGAGGACAGACTCCACACAGCATAGTGCCTCAGGCTGCACATGAACACATGGACTTGCCCAAACGCTGGCATGTGAAAGGTGGTGATTAGCTGTGGTGTCGGGTGCCTGTGTGCCGCTGTCGATTTCCCTGAGCTGATTTCACACTTGGAGGCCAGAGCTTGAAGAGGAGAGCCTGCATCAGTCCTGTTCAAAGAGACAAACAAGTGGATATGGATTTTAAATATGGATCTTTAAAAAAAAAAGTTTACTGACATGGTGGGGGGGTTGGGGGAAAGACTAAAACCTTGTTCTGTAAGTGAAACTTACTCACATAATTCTTTTATCCATTTGGCCTACAATACAAGCCCCATGACTCTGGGTAATGATACTGAATTGCTGTTAGCAAAAAATGTACATTAATGGCATAAATGCCATGAGCATCCCAGCTGGAGCCACTACGTGTCCTCAGTACTTCAACATTGCAGGAGGACGTTGTTGGGTCAGCGGTCTGTAGACCAGACTCCTGTTCCTGCTGAACTGAGCCAGTGTTTCTGCAGTACTGTAATCAGCTCAGTAGGCACGGGAGGCCAGGTCCATTTGGCTCTTGGCTCTCTTTCAACACAGCTTGTAGGAGATCCATACACAAACCGTCAAACGGGACTAATTCACTTCCAC 4 1 5' arm Ictalurus_punctatus mirnest mir-24 2e-23 dre-mir-24-3 3e-31 -31.5 ......(((((((.((((((((.((((..(((((.........)))))...)))).)))))))).)))))))..... (-31.5)