mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTGTATATTGTATTTGCTT CAATGATAATGCATTATAGA TTATTTACAACCTTTTGTTGTTATTGTATATTGTATTTGCTTGAATTTCCTCATTTGTAAGACACTTGGAGAAAGCATCTGCTAAATGAATGAATGGAAATCCTTAACAATGATAATGCATTATAGAAATAAAATGATAAATACT TACATGGTGGCAACATGTAACCATTTATATAAGTGTAAACACTAAATGTATCCTGAAATTCCAAGTAATTTTTGATAGAATTACAAATTATTTGAGGACAGGTAATTCAGGATAGAATTAAGATATTTGCATTAAGTTTTTTTGTTTATTTTCTAATGTATTTTATTTTAATTAGTGGAATCTGTCATGGTTATTCTTTAAAGGCCAAGTGGCTGAATTGTGTGAGTGAGTGTGCCAAAAAAGACAAAAAAATAAAACCAGTATGGATTTTACTGATTGAAATCACTTCCTGATGTCTAAAATCTAAGGTTCTGGGTGTAAACTTGATTTGTTTACAGAATATTTCCTTTCCTTTTAAAAGCTGCTATCTATTTTAGCAGAGATCAGCTAAAACTCGTGTACTATGTAAAACTCGAGAATACTTTCCTTTCACTGTGTACGTCCTATTGACCAACATATCTTCTGTTTGCATTTCTTCTGTTTTGCATTTTTTGGAGTAAATAAATGTAGCTTATGCATGTAATAATAGGATTATACAAATAACAAATACAAATAACCTTATACAAATCTCAATTTAAAAAAAAGACTAAAAGTATAAATGTTAAAAAATTGTATTTACATTTTATTTACAACCTTTTGTTGTTATTGTATATTGTATTTGCTTGAATTTCCTCATTTGTAAGACACTTGGAGAAAGCATCTGCTAAATGAATGAATGGAAATCCTTAACAATGATAATGCATTATAGAAATAAAATGATAAATACTAT 4 1 5' arm Ictalurus_punctatus mirnest UnaL2 0.00003 100 -23.8 .((((((((...(((((((.((((.((.((((((..(((.((((((((((((((((((.(((..(((.....)))..))).....))))))))..))))))..)))))))..)))))).)).)))).))))))))).)))))).. (-23.8)