mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAACCTGAATGAACTTTTGG AAAGGTTTGTTTGGGTTTTTC TTCAGTTGGCCAAAAGGTTTGTTTGGGTTTTTCTGTAATGCTATGAAAAAACCTGAATGAACTTTTGGGCCAACCCA GAGAGCAGCTTGGGAAGTTGATTCTGGTCACCGAAATACCTATTATGCCTCTATTGCAAAGGCATATGNCTGGAGTATCGCAAATCAGTTAGCTTCCGATGCTGTTCAGATTTTTGGAGGCAATGGATTTAATACCGAATATCCTGTAGAAAAATTAATGAGGGATGCCAAGATCTATCAGATTTATGAAGGTACAGCACAAATTCAAAGGCTTATTATAGCTCGTGAACACATTGGCAGGTATAAAAACTAACCAGATCACCGTGTTAATAATTCTTGAGTAATTAAAATAAGATCTACTGTTCTAAACTCCAGGAAAGAGGAAGGGCTTTAAGGTTTTTTTTGCCAGTGAAAATTTTAACATAGATTCTCTTGTACTAAACCTGTATAACTGATTCTAATAGTATTCAGTTGGCCAAAAGGTTTGTTTGGGTTTTTCTGTAATGCTATGAAAAAACCTGAATGAACTTTTGGGCCAACCCAAGTTTTCTACTTTTGGTTAACTTTATGAC 1 0 3' arm Ovis_aries mirnest 100 bta-mir-2285d 0.00005 -34 ....(((((((.((((((((((((((((((((.((((....)))).)))))))))))))))))))).)))))))... (-34)