mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGCCAAAAAGTTCGTTTGC AAATGAGCTTTTTGACCAACC CAAGTATTGGGTTGGCCAAAAAGTTCGTTTGCCTTTTCCCATAAGATGTTGCAAAAAACCCAAATGAGCTTTTTGACCAACCCAGTGTTT GGCTCAGTTGATTCCCCACAACTCCCTGTGGAAATGTGGCCACCTTTTCTAGTCACGTTGATGGCCTTTCCTTTTTCCTTTCCCCTGCCCCACCAAGTCAATAGGAAGCTGTCTTCCCATCAGGCCAGTAGCGCTCCTAGTTATCTAATAAGTCTGCCATCGCAAGTATTGGGTTGGCCAAAAAGTTCGTTTGCCTTTTCCCATAAGATGTTGCAAAAAACCCAAATGAGCTTTTTGACCAACCCAGTGTTTTAACCCATAAACTTTGAGAAGTTTGGAATACTAGCTTTCATCTTAATAAAAAATGCTTCTCTCTCTTAAGTGACTAACCTTTTTACTCCAGTTTTCCTGTCCACAGGGTAAGTATTTTTCATCAAGCAAGGATATCACTAGGGTGAAATATTCGAGAACCATGTGTTCTGAATGGCCTTACATCACTTATGTAGCACCTCTTCTTCCACACACACAGAAATGGTAAATGTAAATCGAGGAAAATGTGAGTTGTAACAGCCTCTGTTCCATGTAAAGATCTGTGTTTTTCTGACAGGTACTGCACCAGCTAAAGAGACTGGGAGTTGTGTGGCAGGATGTCCTGCCGGTGAACATATATTGCAAGGCTATGGGGACTTTACTCAACACAGCGGTCTCTGAGATCATTGGCGGGATCAC 2 0 5' arm Ovis_aries mirnest 100 bta-mir-2284x 0.0003 -30.5 ....(((((((((((.(((((((((((((((..((((.................))))..))))))))))))))).)))))))))))... (-30.5)