mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCCGCCTTGCATCAACTGAAT TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA CGGCAGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAATCAGCTTCCTCGTACTTAAATTATACGTATATATAACTATAATCTGTTTAAGCGAGAATTAGGTTCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGACCGCG GATACACAAAGATATCAATCTTTCCTTTGTAGGGCGGTCCCCCACCCGGCGCCGGCGCTCTCTGTAGCTCAGATCTTGTGCGTGCATTCGCATTGTTTTGTGTATTGCGGCAGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAATCAGCTTCCTCGTACTTAAATTATACGTATATATAACTATAATCTGTTTAAGCGAGAATTAGGTTCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGACCGCGGTGAATTTTGTATCTCAACAGCCGGATTCAGATGAATTCTTTAATAGATTTGGCTTCGATTACGTTATTATTCGAGTGTGATGGAATATTAATGGATCTGAGTGAAATAAATACGGATCTTGATTATCTTTATCATGCTACATGTGATTTGGTAATTATCCGTTCAATTAATTGTATCATAAAGGAAAGAGGATGCTTTGGCAGTTAATAAG 2 0 3' arm Fraxinus_excelsior mirnest MIR168 0.0000000001 tcc-MIR168 0.000000000007 -48 ..((.((((((.(((((.((((((((((.((((((((......(((((..((((((......((((......))))....))))))))))).....)))))))).)))))))))).))))).)))))).)). (-48)