mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAAAGTTCATTCAGGTTTTT AGACCCAAATGACTTTTTTGG TACAATACTGGCAGAATTTATTGGGTTGTCCAAAAAGTTCATTCAGGTTTTTCTATAACATCTTATGGAAAGACCCAAATGACTTTTTTGGCCAAGCCAATAATTTTGATAAGCAGTCC GAGACTAGACTGTTAATGGTCTGCTTATCTTTGTATCCTCAGAGGCTAGAACTGAGTAGTAAATATTGAGCAAATGAATGAATGAGTTTGATGATGCCTACTACTCGTTCTTGCCCCTCACTCCTAAGTTCCTGGTCCAGTTCTCTTTCTGGACTGGTGTGCTTATCCAAGTGCACCAATACTTTACAATACTGGCAGAATTTATTGGGTTGTCCAAAAAGTTCATTCAGGTTTTTCTATAACATCTTATGGAAAGACCCAAATGACTTTTTTGGCCAAGCCAATAATTTTGATAAGCAGTCCTTTAAATATTGCAGTAGGAAATCTGGTCTCTCCTGTTAGATTGGTTTTACAAAGTTAAGTACTTTGCTGGTCTGTTAACCTTAACAGAGCCCCTGGGAGTGCTGCAGTAACTCTAGAATTCTAGAGCAGAGAATATAATTAGGCACTGATAGAAGGTAAACTCGGAGAAGGCGATGGCACCCCACTCCAGTACTCTTGCCTGGAAAATCCCATGGACAGAGGAGCCTGGTAGGCTGCAGTCCATGGGGTCGCTAAGAGTCGGACATGACTGAGCGACTTCAATTTCACTTTTCACTTTCATGCATTGGAGAAGGAAATGGCAACCCACTCCAGTGTTCTTGCC 3 0 5' arm Ovis_aries mirnest 100 bta-mir-2284w 0.00000002 -37.7 ......((((.(((((((.(((((.(((.((((((((.(((((..(((((((((((((....)))))))))))))..))))).)))))))).))).)))))))))))).....)))).. (-37.7)