mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAGACTAGTGATTTTGTT CAAATCACAGTCTGCCATA AAGATTCAGTGGATGTTGGTCTAGTTCTGTGTGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTTTTTAGATAACTGAATCGACAACAAATCACAGTCTGCCATATGGCACAGGCCATGCCTCTACAGGACAA AACCTTAAAAAGCTTCTCTTTCTCAGCTAATTTTTCTTTTAGAAGCCATGGTGTCTCAACCTTTTGGGGACCTAACTTCTAAACATTCTAATAGCTTTGCTTTAATTTTCTTCTGCCTTCTTGCTAAAACATGAAGACATTCGATACTAATCTTACTGGAAGAAGCCTTAACCAAGCAAACTTCTCATTTTTCTGGTGAAAACTGCTGCCAAAACCACTTGTTACAAATTATACAGAGCCTGTAGAAAATGTAGAAGATTCAGTGGATGTTGGTCTAGTTCTGTGTGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTTTTTAGATAACTGAATCGACAACAAATCACAGTCTGCCATATGGCACAGGCCATGCCTCTACAGGACAAATGATTGGTGCTGTAAAATGCAGCAATTCACACCTTAACTGGCATTTCTTTGTCTTTTCTACCATATATTAACAATTCTGCTCTACTAATGTCTGATTTACTATTAATCTTTTTTCTTGGATTTTACATTGCTCTAATTTGTAATTACTAATGTTTTAGTTCTTATCTCTAATTGTGTAATGGACATGTTTATCATTTTAATTTAGCATTGAAATTGTCTTAATGTTAAGATTGACTAAGATGTTACGAACAAAATTCTAATTCGTACTTTTTTTTCTTTTCTTT 1 2 5' arm Ovis_aries mirnest mir-7 1e-35 bta-mir-7-2 3e-57 -43.6 ....(((.(((((.((.(((((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).)))))))..)).))))).)))... (-43.6)