mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGCCAAAAAGTTCGTTCAG GGGGGCCCTTTTTGGCCAACC ACGTTCTTTTGGTACTGGGTTGGCCAAAAAGTTCGTTCAGGTTTTTCCATAACGTTTTACAGAAAAACCTGGGGGCCCTTTTTGGCCAACCCCGTACTTTTTTTAGA GGTCCGGATTCCCGGGATGGCCATTGCAGAGTAACGAGTCCGGTTCTCTGTGCCGCGCAGGAGGTCCTTCTCTCCTATGGTATATATAGTAGTGTGTACGTGTCGATCCCAATCTCCCAATGTATTCCGCCCCAGCTTCCCTCCCTTGGTAACCATAAGTTTGTTTTCTGCATCTGTGTCTATTTCTGTGTTGTAAATACGTTCTTTTGGTACTGGGTTGGCCAAAAAGTTCGTTCAGGTTTTTCCATAACGTTTTACAGAAAAACCTGGGGGCCCTTTTTGGCCAACCCCGTACTTTTTTTAGATTCCATGTGTAAGCAGTCTCATATGATTGAAATGGTGTCCTTTAATGGGACGAGGACTCCAGGGCACAGCACTTATATTAATATGATGGGCAACATGTGTGGAGGTCCTCTCCTGTTC 1 2 5' arm Ovis_aries mirnest 100 bta-mir-2284x 0.0000003 -43.1 ....(((...(((((.(((((((((((((((.((.((((((((((((..(((....)))..))))))))))))))..))))))))))))))).)))))......))) (-43.1)