mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTCAAGGTGACGTGGATGACA TTATTTATATTATCTTGACTT CGGCACCACCATGAATATCCTTTATGGTGAACGCGTGTGCGGTCAAGGTGACGTGGATGACATGAACACAATTGTCACTCATTATTTATATTATCTTGACTTGATGGGTGTGGGCCGTGAGGAAGCTGGGCCCCACGAGG GGTTTGGTACGACCGGCAACAAGACTACGCAGATGAAGGAGATTGCAGCTTTTCTTGGTCATGTCGGCAGTCAAACTTCTTGTGGTTATGGATTTGCAACCGGAGGACCCACAGCATGGGGATTATGCTACAATAAAGAACTAAGTCCTAGCAAAGACTACTGTGATGAATACTACAAGTACAATTACCCTTGTGCCCCTGGAGCGGAATACTATGGACGTGGTGCTTTGCCCATCTATTGGCAATACAACTATGGACAAATCGGCGACGCCCTAAAAGTCGACCTCTTGAACCACCCAGAATACATCGAACAAAACGCCACCTTGGCGTTCCAAGCCGCAATCCACAGATGGTTGACCCCAATGAAAAAAGGTCAACCCTCGGCCCATGAGGCCATTGTGGGCACATGGAAACCCACCAAGAATGACACATTGGCCAACCGGTTTCCAGGGTTCGGCACCACCATGAATATCCTTTATGGTGAACGCGTGTGCGGTCAAGGTGACGTGGATGACATGAACACAATTGTCACTCATTATTTATATTATCTTGACTTGATGGGTGTGGGCCGTGAGGAAGCTGGGCCCCACGAGGTGCTGACGTGTGCAGAACAAAAACCGTTCAATCCGTCGGCTCCGACCCAAGCGTCTTCAAGGTAAGCGTGTTTGTTTATCGTTCTTGATTCTCTCCATGAATAAATGGTGGTTGCGTGGAAATATGTAAGTTTGTGGAATCGTCTGTTAATAGATTTGAAATTTGATTCGTTGTTAAAGCGTGTTGTATTTAGTTTGTGAATTTTGCGATATCGAAGTTATATATGAGTATATATTGTTTGAAGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCAAGGGGGGCCCCGGAACCCATTTCCCCCT 3 0 5' arm Gerbera_hybrid_cultivar mirnest 100 100 -42.8 ......(((((((((.....)))))))))..(((....)))((((((((((.((((((((..((((((....)))...))))))))))).)))))))))).......(((.(((((((......))..)))))))).... (-42.8)