mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTCTCTAACCGATACTGCATG GTTGCAGTGTCGGTTAGAGAAGCT TCTTTATTAGACTTTATTCTAGTTGCAGTGTCGGTTAGAGAAGCTGTGCAAGCTTCTCTAACCGATACTGCATGGAATAAATAGTCATTATA ATTCAAAGTCTCCAAGAACCACCACCTCCGCAGATGGGTACTGCTCAAGCACGCGGCTAGTCCCCTCTTGCACATGCTCAAACAGAGCTGAACCTGCATCACTGCTGTGGGACCTGTACAGGCACGCGTAGATTCGGCTATTCTTTATTAGACTTTATTCTAGTTGCAGTGTCGGTTAGAGAAGCTGTGCAAGCTTCTCTAACCGATACTGCATGGAATAAATAGTCATTATAATTATAAAATATATTTCTGTTTACATACCATACAATTTTCATAGTTCAAATATGAATTGGGATTGATATGAATTTATTTCGATTATCAAAATAATTGGTATTAAACATTTATATTTCCTCAAAATTTCTATATTTATAATAATGACTGTGACCACCCCATAAATCACAAAATTAAAAATATTAACAGATAACTTATTTTAAAATCATATATTAAAAATGATAAACAGATCG 0 2 3' arm Bombyx_mori mirnest 100 bmo-mir-2806-2 2e-23 -47.6 .........((((((((((((..((((((((((((((((((((((.....))))))))))))))))))))))))))))))..))))...... (-47.6)