mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAAGGGAAGATATTTGTATGA ATATAAAATGTCTTTCCCAGCG GGTCGCGGGTTCGAATCCCGCCAAGGGAAGATATTTGTATGATAAATATAAAATGTCTTTCCCAGCGTTATGGATGTATATTAAA ATTCATTTTGTTTATCCTACCAACGCTGTTTTCCTGTGCACGCGCATAATTTTTATATTAATCACTCTATAATTTTGTCCCAGTTTGGATATTCATGATTTTTTTTAAAACTAAAATATTGATAACCGCCGTCTGGTGTAGTGTTAAGTACATGGTCGTAACGTAACATGGTCACTACACAAGGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGCCAAGGGAAGATATTTGTATGATAAATATAAAATGTCTTTCCCAGCGTTATGGATGTATATTAAATATGTGTATGTTTACAATAAAAATCTTACATTTATTTCCGTTATCTGGTACCTGTAACACAAGTTCTTTACGAACTTAGCACGGGACCAGTTAACGCGGCGTGAT 5 1 5' arm Bombyx_mori mirnest tRNA 0.00000002 bmo-mir-2818-1 2e-20 -23.8 ....(((((.......)))))...((((((((((((((((.....)))).))))))))))))..(((((...)))))........ (-23.8)