mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCAGCTGCATACAAATTTG GGGTTGTATGGAGTTGGAACG CGACAGCTCTGTGTGCTTAGTGCCAGTTTTTTAACGTTCTCGCTGGCATAAAGGTTAAGTCAGGGTTGTATGGAGTTGGAACGTTTGCCTATGTTTGCCGCTAGGGGCATTGTTCCAGCTGCATACAAATTTGACTTAACTTTTACGCTAGCGGGAATGTTAAAAAACTCTCACTAAGGACACAGATCATCT ATTCACTGAAGCTCATCCGCTTCCAATTAAAGGGCAAGAATCCCCTGTACCGCATGGCGAGCACGCCCGTGCCAATAGAAGACAACCGAGTCTAAGAAGATGAAATCGACAGCTCTGTGTGCTTAGTGCCAGTTTTTTAACGTTCTCGCTGGCATAAAGGTTAAGTCAGGGTTGTATGGAGTTGGAACGTTTGCCTATGTTTGCCGCTAGGGGCATTGTTCCAGCTGCATACAAATTTGACTTAACTTTTACGCTAGCGGGAATGTTAAAAAACTCTCACTAAGGACACAGATCATCTGAGGAGAAGAAGTCCCAAAGTTAATTACGAAACTATTCAAAATGGCTGTTCTAACTAACAACCTGCCAACAAATAACGAACGGAATGGGTATAGTCACGGATGTGTGATTCTTGTAGGCATTTGTACAAATGGAATTGGGTAGCATAATATAGATTATTTGGTAATTGGAATGTGAAAGTTTTAGTCGTAATGGGTATGTGTATAATGAAAATTTCTTGAAACAAAAAGTAGCAAAATAAATGGCCGTGTAAAATTGGTAATTAAATATTTAGTTACGCGTTTTTAAATGGATATTTCAAATGATC 2 0 3' arm Bombyx_mori mirnest mir-2807 2e-29 bmo-mir-2807a-2 1e-29 -100.7 .......(((((((.(((((((..(((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((.(((((((.((((((((((..(((((..((.....))...))))).)))))))))).))))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))..))))))).)))))))...... (-100.7)