mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCAGCTGCATACAAATTTG AATTGGTATGGAGTTGGAGCG TACGAGTTTTTTAACGTTCTCGATAGCGTAAAAGTTAAGACAAATTGGTATGGAGTTGGAGCGTTGGCTATGTTTGCGGGTAGGGGCACTGTTCCAGCTGCATACAAATTTGACTTAACTTTTACGCTATCGAGAACGTTTTTTTTTTTTT CGAATTCCACCGAAGCAACCATGCCCAGTGAGCACCTGCGTGAGCCGGAAAGTGAGGCGTCCTCTGTCACGATTCACCCAGTTCACAAGAACCGGGCGAGTCGCCTGACTAGATTAGCTTATACGAATTAAAACCAGTGCTCAAAATCGCAAGCTAAAGCTGTTTTCATTTATATCTACTTCTCAATCACGAATACTGTAACTTATCCACAACCATAACTATCCCTGACTCGTCCGTAATAGCAAATAAATAAAAATCGGAAACGAATTTCACACACGGTCATCTTGGTGGTTAGTACGAGTTTTTTAACGTTCTCGATAGCGTAAAAGTTAAGACAAATTGGTATGGAGTTGGAGCGTTGGCTATGTTTGCGGGTAGGGGCACTGTTCCAGCTGCATACAAATTTGACTTAACTTTTACGCTATCGAGAACGTTTTTTTTTTTTTTTTATGGTCCTTGTAGGCAGACGAGCATAAGGCCCACCTGATGGTGAGTGGTTACCGTCGCCCATGGACTTTAGCAATACCAGGGGCAGAGCCAAGCCGCTGCCTACGTTAAAAAACTCGCACTAAGCACACTTGTGCAAGACTAGATTCATTATTCTA 2 0 3' arm Bombyx_mori mirnest mir-2807 5e-32 bmo-mir-2807a-2 1e-22 -66.7 ...(((......(((((((((((((((((((((((((((.((((((.(((((.((((((((((...(((...............)))..)))))))))).))))).)))))).)))))))))))))))))))))))))))......))).. (-66.7)