mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCAACTGCATACAAATTTG TATTTGTATGGAATGGGATC GGAGTTCAGTGTGCCTTAGTGCCGAGTTTTTTAATGTTCTCGATAGCGTAAAAGTTAGCTCATATTTGTATGGAATGGGATCGTTTGCGTACGTTTGCCGCTAGGGACGCTGTTCCAACTGCATACAAATTTGGGTTCACTTTTACGCTGTCGAGAACGTTAAGAAACTCTCACTAAGCACACTGTTCGCAA GTAGATTCTGCGAAGCACGGCTCTCGCTTGTGTTAAGAAATTCTCTCAGGTTGTGCCCCTGAGCTCACCTACCAGTCACAGCGTAGTTGGTATAGCCCCTTAGACTACCAACGAATAAGTAGGGGAAAAAATAATAAAAAAATTAACAGGTACGATACGCTTGTTTTTAGTTTACGTGATAAAAACTGTCCGTACACGTACCACGGGATCCGCATTATACTCGCAAGTATCCTTTAAAATAATTGAGCGTTAGGAGTTCAGTGTGCCTTAGTGCCGAGTTTTTTAATGTTCTCGATAGCGTAAAAGTTAGCTCATATTTGTATGGAATGGGATCGTTTGCGTACGTTTGCCGCTAGGGACGCTGTTCCAACTGCATACAAATTTGGGTTCACTTTTACGCTGTCGAGAACGTTAAGAAACTCTCACTAAGCACACTGTTCGCAAGTGAATTAATGGAGTTAATAGAGCGGACTGTTTAAAAAAAAGTACATACATTAATCTTCAAGTGATGCCTTAAAATACGTATTATAGGTACGAATGAATTGTCTTTTGCCTTA 4 1 3' arm Bombyx_mori mirnest mir-2807 4e-39 bmo-mir-2807d 2e-25 -87.6 ...((.((((((((.((((((..((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((.(((((((((...((((((.....((((................)))).))))))....))))))))).)))))).)))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))...)).. (-87.6)