mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCAACTGCATACAAATTTG AATTTGTATGAAGTAGGAACG TAAATAAAACTAATTGTTATGACCAGTGTACTTAGTGCGAGTTTTTTAACGTTTTCGATAACGTAAAAGTCAAATTTGTATGAAGTAGGAACGTTTGCCGCTAGGGACGCTGTTCCAACTGCATACAAATTTGAGTTAACTTTTACGTTATCGAGAACGTTAAAATATTGGCACTAAGCACACTGATGTCAATTATCTTCAT ATTCCTGGAGCCCATAGCCATCTACAACTTAAATGCGCCACCCACCTAATTAAAAAGTCTCCAAATCGCAAATATTTGCCAAAGCTATGTAAATATTTTGGATTCCATGGGTCGTCTAATGTGTATGCACTCACAATGTTGTATGTCACTTTTTTTAAATAAAACTAATTGTTATGACCAGTGTACTTAGTGCGAGTTTTTTAACGTTTTCGATAACGTAAAAGTCAAATTTGTATGAAGTAGGAACGTTTGCCGCTAGGGACGCTGTTCCAACTGCATACAAATTTGAGTTAACTTTTACGTTATCGAGAACGTTAAAATATTGGCACTAAGCACACTGATGTCAATTATCTTCATCTGTAATTTATAAGGAAAAAGAAACTGATTTCAAATAACTTTTATTACTATACAATTTTCAAGATAAACCTGAAAATGTG 2 0 3' arm Bombyx_mori mirnest mir-2807 2e-29 bmo-mir-2807d 1e-23 -81.9 .......(((.....))).((((((((((.((((((((.(((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((.((((((..((((.....)).)).)))))).))).))))))))))))).....)))))))))))))))))))))))))).))).)))))))).))))))..))))........... (-81.9)