mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCAACTGCATACAAATTTG AGTTTGTATGGAGTTGGAACG CGTGTGTTCTGTGTGTTTAGTGCGAATTTTTTAACGTTCTCGATAGCGTAAAAAATAACTCAAGTTTGTATGGAGTTGGAACGTTCGCCTACGTTTGTCGCTAGGGGCGCTGTTCCAACTGCATACAAATTTGAGTTAACTTTTACGCTATCGAGAACGTTAAAAAACTCGCACTAAGCACGCTGGTCGTAG GACTGACCAACATAGCCGTGTGTTCTGTGTGTTTAGTGCGAATTTTTTAACGTTCTCGATAGCGTAAAAAATAACTCAAGTTTGTATGGAGTTGGAACGTTCGCCTACGTTTGTCGCTAGGGGCGCTGTTCCAACTGCATACAAATTTGAGTTAACTTTTACGCTATCGAGAACGTTAAAAAACTCGCACTAAGCACGCTGGTCGTAGAGGTCGAAACACCGACTTGTCGCTTCCCCGAGTTCAAGACAGCGGCGCCAGAGAAAGCAAATTTGGGCCCGCCTATACGTCATGGTACACGGTAACGGCACAGCTGCGGCACGGCTCTATATTGAATTTTGATTACCGCTAGCTGCCGCTGTTGCCTTTTTATACTAACGTTATGAAACATATTATGCGACATACGATTTAAGGGTCAAATTCTAATGACAAGCTAATGGCTGGTTGGGAACGGGTGCAGTTGCCGTGCTTGCATAGTGTGCCGTGACCCTTAATGTTTCGTTCCGTGTGCCGTAACCAACCAGGGCCTTAACAAGACTACATGAAAACTGCTTTACACATATGTGGCTATAGAAGGTCACATTCATATATTCGTTTGCTCTGTCATCTCTAAACCGAGGTCAAAAGGGCCCCTTTAAGGGGTCAAGAGCCCGACTGGACTGAGC 1 0 3' arm Bombyx_mori mirnest mir-2807 3e-40 bmo-mir-2807d 1e-26 -104.3 ..((...((.(((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((..(((((((((((((((((.((((((((((..(((((..((.....))...))))).)))))))))).)))))))))))))))))..))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))).)).))... (-104.3)