mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGAATATTGGTGCTGTGCAAT TACGCGCGTTAAATTTGGG TCTCGCCAACCCGAATATTGGTGCTGTGCAATTGGTATGGGAGAAAACATGCAGATCTAATTTTCTTCTTGTTTTTTATTATCTGTTTACGCGCGTTAAATTTGGGTGATGATT CAAGTGTTCACTGTAACAGTAATTTTTGTACTAATTGTTTTCATGTATTTGGTTAATCTCTTTCTGAAACATATTTCTCGCCAACCCGAATATTGGTGCTGTGCAATTGGTATGGGAGAAAACATGCAGATCTAATTTTCTTCTTGTTTTTTATTATCTGTTTACGCGCGTTAAATTTGGGTGATGATTTATTTCCATGTCCATAAATAATAATGAGAACTAGATAAAAAACATAATGTACGACTTCTCGCCCTGAGCTAAGTTGCATAAAAAATGCTTGTAAATTTTATAAGTGCACGGTTAGTCTGAATTCATCTTGAATGTTGGGTGTGGCATGGTAAAGAGTATCATTCTTTTTTAATCTGTATGAGATGGTCAGGGGCAGCAACTGCAACTGTACACTGTAACAGTAATTTATATACTAATTGCTTCATTTGGTTAATAACCCGAATATTAGTATTGTGTAATTTATATGGTAGAAAACCATGCAGCTCTAAAATGAAAACTAATTTAGAAGTAATGGTACACCAATTAACTTAGCTAGAATTGAAATGGCAAATGATTTAATATGCTACCGCTGATATTTTTAGATGCTAACTAAATAAACATATTTATGCGG 2 2 5' arm Aedes_aegypti mirnest 100 100 -24.2 ..(((...((((((((.(((((((.(((.((.(((.((((.((((((((...(((........)))...)))))))).))))))).)).))))))))))))))))))..))).. (-24.2)