mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCTGTTGCCTCTGCAGTTGC ATTGTTGAGCCGCAGCACT TATGTTTTCGGCATTGTTGAGCCGCAGCACTGTGACCAAGTCATCTATTTCAAAGACACCTGCTTTCCCGCGTTGTAGATTGATCCCATTGAAAATACTTGGCAGAGGTTTGCCGGAATCCATATCTTCGACATCTCTTCTGGTTTCATCCTGGTGCTGTTGCCTCTGCAGTTGCCGTTCTTCC ATGCATGGATTTGATAATTTAATTTATTTCTAGTTTGTTGTAACTCTACGCCAGTGCATTCCCATCCGTTGGGTTTGTCCTCAATGGTTTCAAGTCATTCAAATAGATAGAATGCCGTTCAAAAAGTTCCACCAACGGCTCATCCGGTTTGTTGCATTCCTTATCAAACTTGGCTCCGATCGCCCAAAGCGACTCCAGATCGTACTGATCTCGAGCCGTTTCTGAGAATACGTGCAGCGCGATGTTTCCCAGGTCCAGTGCCATCCAGTCGCGACTGTTCTCTCCTTCAATCCTTGGGATTACGTCCGACTGGTTTCGCTTCATTTTGTACACCTTGCGAACGAATTCCGATATTCCTCTCATATGGCGAAAGCTCATGCCCGTCACGACACAGATGAAATCTACATACTTGAATTCTTTGGGCACGGAACACACGAATATGTTTTCGGCATTGTTGAGCCGCAGCACTGTGACCAAGTCATCTATTTCAAAGACACCTGCTTTCCCGCGTTGTAGATTGATCCCATTGAAAATACTTGGCAGAGGTTTGCCGGAATCCATATCTTCGACATCTCTTCTGGTTTCATCCTGGTGCTGTTGCCTCTGCAGTTGCCGTTCTTCCTCGACATCCAGAATCACCGATGCGTCGACATCGCGGAAAATTTGATACTTATTCGCAATCGATCCGGCTGAAGGAATGTGCTGTTCCTGTTTGTTCGTATGTTTCTTTGGAGTGGCTGGATCTGGCGAACTGAATTCATCGTGAAAAAGGCGTGCGATTCTTGTGCAGGAGAGTCTACTGCTTGTCGATAGCAATTTTTGCACGACTAGTGCCATTTTACTAGCGATTTGTGTGAAACGTGAATCTAAAGTTGACC 2 2 3' arm Aedes_aegypti mirnest 100 100 -44.8 ........(((((((((.((((.((((((((.((.((((((..((....((((..(((..(((......))).)))...)))).......))....)))))))).(((...(((((((...................))))))).....))))))))))).).))).)))).)))))....... (-44.8)