mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCTATGCATATACCGCTTT AGAGGCATAGGGCATGGGAAAA CGAGAGGGGTATCTGCACTCGCTGTTCCTTTTTCCTATGCATATACCGCTTTGAGATCTAGCTTTAAAGAGGCATAGGGCATGGGAAAATGGGGCTGCAGAGGTATTTCACCGACCA CAGGGTCCACAGAGCAGTGCACTCGAGAGGGGTATCTGCACTCGCTGTTCCTTTTTCCTATGCATATACCGCTTTGAGATCTAGCTTTAAAGAGGCATAGGGCATGGGAAAATGGGGCTGCAGAGGTATTTCACCGACCAAACTACCCCTGGTTGTTCAACTACCACAGCCCTGAGTTCTCCCTGTTTCCCCATTTTGGACCTCGATCGACCTCAACAAGACCACACCCTGAACTCAGTGGAGAGACCATACCTCGTAAGGAGAGACTGGATTTTACAATGTCCGGATGGCTCCTTATTTTATTTATGATAATGCATAATGCATGATGATAATGT 3 1 5' arm Oncorhynchus_mykiss mirnest mir-202 1e-28 dre-mir-202 2e-24 -38.2 .......(((.((((((......(((((.(((((((((((.(((.((.(((((((.......))))))).)).)))..))))))))))).)))))))))))(((.....))).))). (-38.2)