mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAACAAATCACAGTCTGCCAA GGAAGACTAGTGATTTTGTTGTT CTTCCCTGCCTGTTGCTGTGTGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTTTTTAGTTAGATGAATCGACAACAAATCACAGTCTGCCAAACGGCACAGGCTCCTCCT GAGAGTGTCAAGCAGATCCGGCATGAGTCTGGCGCCTCCATTAAGATCGACGAACCACTGGAGGGTTCAGAAGACCGCATCATCACCATCAGCGGCACCCAGGACCAGATCCAAAACGCTCAGTACCTATTGCAGAATAGGCAAGTTCTGGATGCCCTCTGAGTGAATAGAGATCATGTCTGCCTTTCTATACATTCTCCTCCCTGTTTTAACTTACTTTTTGATCTCAAAATATGTCTAGATGTATATATATTTTTTACCCTCTTATTTTATTTCTCTGTCTGCTGATGGTGACTAACCACTTCCTCCCATGCAATGTGCAGGTAGTTTGAGCTTCCCCTTGGGAAATGTCTGCGTATTAAACTGTACAGAATTATTGTATAACTATTATTATATTGATACGAAACTGGAGATCCATATTTTAATTGGTAATGTCTGGTTTTTGAAGAATGTGATTGGTGAATTGTGATTTTATGACTTAAGAGCCGTTTCAGTGTGAAGCAGGGAGTGGACCTCTTCCCTGCCTGTTGCTGTGTGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTTTTTAGTTAGATGAATCGACAACAAATCACAGTCTGCCAAACGGCACAGGCTCCTCCTCTTCTGTCTCCCCAGCAACCCTCAGCCTGTCTCATTGCGTGGATGCTAATATGCTAACGCTGCATCGTAGCCATGGTGACT 2 2 3' arm Oncorhynchus_mykiss mirnest mir-7 8e-36 fru-mir-7 3e-32 -39.7 .......((((((.(((((.(((.(((((.(((((((.((((((((((......))))..)))))))))))))))))).))).)))))))))))....... (-39.7)