mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGTACCGTGAGTAATAATGCA CATTATTACTTTTGGTACGCG TGCTTTACGGTCCATTATTACTTTTGGTACGCGCTAGGCCAGTCTCAAACTCGTACCGTGAGTAATAATGCACTGTGGCTG ATGGCTCAGGCAGAATCGGACGAGGGTCATTCATGGAGCATTTTCTGCAGATGGAGTGTGTTACACTTCACAACTATTTTATCAGTTGGAAACACACACAGGAATTCCGGCTTGGGATTGACCATCAAGTTCCTGGCCACTACAGGAAGGTGTGCATAAAAAGCACTTCCAAAGCTGGCAGCCTCTACCAGTCCTCTCCATTCAGCGAGGGAACACAAGGGAAGTACACATTTGTATATATTGATGAAACCAAAATTGGGAGATGGCCTAGATGATAGGCCTGAAGTCAGTCAATTAAGTAGAGGTGATGTGGCAGCAGCAACCACGGAGTCTCAAGACGCTTGGCATTGTGTTCTCTATTATATGATGGAAGCTACCCTTACCTCTAACCTCAACCGCCAATGAACCTGGAGGCCTGCAGTATTTCAAAGTGGGATGGGATTGTTGACTCCTCTAAACCAGACCAAACCTTGGATTTCGTCCCACAGAAAAACAAGATCAAGAGTACCTGCCTGCTTTACGGTCCATTATTACTTTTGGTACGCGCTAGGCCAGTCTCAAACTCGTACCGTGAGTAATAATGCACTGTGGCTGTCACTGCCAACGAGGGACAGACCACACCACCATATCTTACTTTCACTGTTCTCCATATTCCTATGCATCTCGTTGTTGTAAAGCAAGAAATGTGATGTATTCATGAAAACAGTGTTTGAAACTCTAAGGCCTTGTGTGGGGAAAGACAGCATTTTAATATAATCATTTGTCTACTTTCATAAACAGACTATTCATTTTACTTAAATATTTTGTTGAGTTGTTTATATGACATATGTTGAATTTTCTGTACCTTGTGATTGTAAGCTATATATGCCAATAGCATTGTAGGCCTTGTACATCTACCAAGGCTTCAGTTGAAATACCCCAACATTTGTTGTGATCTGAGCACCACAATACTTTCTTTGCCTT 2 0 3' arm Oncorhynchus_mykiss mirnest mir-126 6e-33 dre-mir-126a 2e-32 -27.9 .(((..(((((.(((((((((((.(((((((.((...)).(((.....)))))))))).))))))))))).)))))))).. (-27.9)