mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATATTGCTTCTTGGTGCAG TCATTAAGGGGTTTTGTGACT AACTTATTTTTTCATATTGCTTCTTGGTGCAGTTAATTTTTTTATCTATACTTCAATCATTAAGGGGTTTTGTGACTTGATTTAG TCGGCGTTTCTTTTTTTGACAACATGAAATGAAATTACAATTGTATTTCAAAGACCATTTAATAAATAGTAACAAACAAAAGACTCTGTGCATTGCACCATTCAATAACAATCAGCCAGTGAACGTTAGCACTCAGTAGACTTGTAGGACATTACAACTACATTCCACAGCTTCACGTGTAAGTATCGTGAATAAGATTGTGTTGTAGACCTTGCCTGGCTGAGCTCAACGTCGACAGAAAGCAGGATCAGTGTTTAACAGTACATTCATATTTAACAGAAGTGCATGATGCATTCAACAAGTGCCAACAATTAAGACCGTTAACTTATTTTTTCATATTGCTTCTTGGTGCAGTTAATTTTTTTATCTATACTTCAATCATTAAGGGGTTTTGTGACTTGATTTAGCAGGGACAACTTGATTTTATTTATTAGCCGGCAATGTCTATTTTAATTAATCCAATCCTGCTATTGAAGTTGATGACTTCACAGCTAGTACTTTTCCATGAAATGTCAAAATAAATCCTTAGTAATCATATGATGCAAACTGTATATTTGCTTAATTAGTCTGGTCAACAGGCAAATAATCGCCAAACCTTCATTTGCACGGTAAAATGAATTATTTGCATTATTATTCACAAAGTAATCTGCCAATATTTGGCATTCGACTTGAAGTCTTAGATGAATCACTTCTGTCATTTTATCCCCGGACCTGTTTTGGACAGGTTTGGACCCTTTGGATGTATCGTGTATGTATCTGCTTCCTGGCGCTTGCTTCCAGTGCTGAACATTTACATTTCTCTGGACCAATGTGCTAGTACTCAGGTCAAGCATCACTCTGCATTCCAGCAGTCGTGCCAGTANGTGACAATTGAGCATCTGTCCGTCTTTGGGTTCCACTCTCGCAACTGCTGCAGGTGATTGGTCTGGTCTGCCTGCTTANNCCTANTGTGTGANGATATGGNTGATGTGACGCCTCGCCTCTGCACCGTGGGGGAGGGACCATGGCAAAAATATCGCTGTCCTGTGGTGGCCTGGGAATGTTGGAACCCGTTTGTCCTCCGGAGNTTGGTTCCCTGGGGAAGCCTTGGGGGCCCCTGGTTTTTTTTAGGGAATTGGCGGCCCCCCTTTCCCGAACCGGGGTTCTTGGTTTTTTCCTCCCCCGGGGCGGGTT 5 0 5' arm Gasterosteus_aculeatus mirnest 100 100 -12.2 ...........(((((..(((((((((((............................)))))))))))..))))).......... (-12.2)