mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACAGCTTTCTTGAACTG GTTCAATAAAGCTGTGGGAAG TTCAATATCATATGGCCCTCTTTGTATTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATTCAAAGAGTTCCTTTGCATGCATGCCATGGCACTCTTGCTCCCACCACACCTTGTTTTGCAGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACAGATAGGGTCAACCATAACGGA GACACCTTTTCTTTCTGCTTAGCCTCTTCTATTCTCCACCTCTTCTTCTTGCTCTTCGATTAGGGTTCTGATTACGTTATGAACCTTCCATGACTTTCCCCCTTTTTTTTAAATCCCCCAAAGAGATTAAATTTATATTCACATACATATATGGGATTTGTGGTGTATCTTCAGTCTTCAATATCATATGGCCCTCTTTGTATTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATTCAAAGAGTTCCTTTGCATGCATGCCATGGCACTCTTGCTCCCACCACACCTTGTTTTGCAGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACAGATAGGGTCAACCATAACGGATTCAATTCTTCACTAAATTAATTAAACAGAATGGTATCAATTGGGTAGAGAGTCCTTATGATGAGTTGATGACGACGACGATTCACTAAGCAATTGTCCTCTTCTGGAATTAAACCCATCAGGGTATTGGGTTCGATCCGATATCAAGTGAATTTCAGCTCACAATTATGGT 1 0 5' arm Glycyrrhiza_uralensis mirnest MIR396 0.00000000000001 gma-MIR396a 1e-53 -63 ............(((((((.((((((((.((((((((((((.((((((((((..((((((((.((...(((....)))...)).)))))...............)))...)))))))))).)))))))))))).)))))))).))))))).((.....)). (-63)