mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCAGTTCAATAAAGCTGTGG ACAGCTTTCTTGAACTGCATT TCAATATCATATGGCCCTCTTTGTATTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATTCAAAGAGTTCCTTTGCATGCATGCCATGGCACTCTTGCTCCCACCACACCTTGTTTTGCAGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACAGATAGGGTCAACCATAACGG GACACCTTTTCTTTCTGCTTAGCCTCTTCTATTCTCCACCTCTTCTTCTTGCTCTTCGATTAGGGTTCTGATTACGTTATGAACCTTCCATGACTTTCCCCCTTTTTTTTAAATCCCCCAAAGAGATTAAATTTATATTCACATACATATATGGGATTTGTGGTGTATCTTCAGTCTTCAATATCATATGGCCCTCTTTGTATTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATTCAAAGAGTTCCTTTGCATGCATGCCATGGCACTCTTGCTCCCACCACACCTTGTTTTGCAGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACAGATAGGGTCAACCATAACGGATTCAATTCTTCACTAAATTAATTAAACAGAATGGTATCAATTGGGTAGAGAGTCCTTATGATGAGTTGATGACGACGACGATTCACTAAGCAATTGTCCTCTTCTGGAATTAAACCCATCAGGGTATTGGGTTCGATCCGATATCAAGTGAATTTCAGCTCACAATTATGGT 1 0 3' arm Glycyrrhiza_uralensis mirnest MIR396 0.00000000000001 gma-MIR396a 1e-53 -61.9 ...........(((((((.((((((((.((((((((((((.((((((((((..((((((((.((...(((....)))...)).)))))...............)))...)))))))))).)))))))))))).)))))))).))))))).((.....)) (-61.9)