mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGTGGCAGTGGCAGTGGCAGT TCCCACTCCCACTCCCACTCC TAACGAACCCCAGTGGCAGTGGCAGTGGCAGTGGCAGCCGCATAAGAGAAGAGAAGAGAAGAAATGGTGGTTGGGCAAGCGGTGCTGCTTAGCGTTGGGGTGAGAGTTGGAGTGACACCCACACACCTCGTGCCCTTCTGTTCTTTCCGCCGCCCCTCTTCTGCCTCCGCAAACCAGGAACAGGAAGACTCAACCACACCCACAAGCAGTACCAAACCGAAACCACCATCATCGAGTTTCGGAAGACTAAAAGCCCAGCAAGTGAAGGCTCTCATACACAGAAACAAGCAGCACCAAAGGCCCTCTCTCCAAGATGAAGATGATGCTGATGATAGACGTTTCAGGGGATGGGGTGATACGGATCCCACTCCCACTCCCACTCCCACTCCCAATCCCC GGTCAAACTATAACGAACCCCAGTGGCAGTGGCAGTGGCAGTGGCAGCCGCATAAGAGAAGAGAAGAGAAGAAATGGTGGTTGGGCAAGCGGTGCTGCTTAGCGTTGGGGTGAGAGTTGGAGTGACACCCACACACCTCGTGCCCTTCTGTTCTTTCCGCCGCCCCTCTTCTGCCTCCGCAAACCAGGAACAGGAAGACTCAACCACACCCACAAGCAGTACCAAACCGAAACCACCATCATCGAGTTTCGGAAGACTAAAAGCCCAGCAAGTGAAGGCTCTCATACACAGAAACAAGCAGCACCAAAGGCCCTCTCTCCAAGATGAAGATGATGCTGATGATAGACGTTTCAGGGGATGGGGTGATACGGATCCCACTCCCACTCCCACTCCCACTCCCAATCCCCACTCTCACTCTCAGAACCAACACCAACACAGGAAACCCAAATCACCAGTGCTGCCGGTGCTGGACAACAACTTTTTCAGTCTTAACTCCTTCAAAGACATAGGCTGCTCTGACAACATCCTTCAATCCCTGCAAA 3 0 5' arm Glycyrrhiza_uralensis mirnest 100 dan-mir-289 0.00000009 -99.4 ...........(((((.(((((.(((((.(((((...(((.((.((......((((.((.((..((((((((.((.....((((((((((.....(((((((.(((((((((.((((....(((.....)))......))))..))))......(((.((((..............)))).)))..)))))...))).)))).))))))))))...))..)))))))))).))...))))......))....((...))..(((...(((................)))..))).....(((((.(((((....(((((......(((....)))...)))))))))).))))).)).)))...))))).))))).))))).))))).......... (-99.4)