mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCCGGGGGACGGACTGGGAA CCCAGTCCCGAACCCGTCGG CTGAGGGCTGGGCACGGGGGTCCCAGTCCCGAACCCGTCGGCTGTCGGTGGACTGCTCGAGCTGCTCCCGCGGCGAGAGCGGGTCGCCGCGTGCCGGCCGGGGGACGGACTGGGAACGGTTCCTTCGGGGGCCTT CTGAGGGCTGGGCACGGGGGTCCCAGTCCCGAACCCGTCGGCTGTCGGTGGACTGCTCGAGCTGCTCCCGCGGCGAGAGCGGGTCGCCGCGTGCCGGCCGGGGGACGGACTGGGAACGGTTCCTTCGGGGGCCTTCCCCGGGCGTCGAACAGCCAACTCAGAACTGGTACGGACAAGGGGAATCCGACTGTTTAATTAAAACAAAGCATTGCGATGGTCCCAACGGATGTTTACGCAATGTGATTTCTGCCCAGTGCTCTGAATGTCAAAGTGAAGAAATTCAACCAAGCGCGGGTAAACGGCGGGAGTAACTATGACTCTCTTAAGGTAGCCAAATGCCTCGTCATCTAATTAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCCACTGTCCCTGTCTACTATCCAGCGAAACCACAGCCAAGTCTTTGGATGGACAGTTCACTCAATTACGCCAAGAAGAAGATCTTGAGAAGGAAATGGAGAGAGCATCGTTGAAGATCCCTGTCGTGTCTCAAAATGAAAATGGAAATGGTCCTCTCTCAAGTGAGTCATCACTAAATCCCGCTGGAGGTGACTCTACCAACGCTTCATCGGAACCCTCCTCCCCAAGGAGCCTGTAATATCATTATTAAGATCACTTGCAGAACAAGAGGAATAAAAAGCGAACAGAAGATGCGTCAGGTGGTATCTTGGTTGCATTCCGACTATGAACTGATGTTGTCAAATCTTTGTTGGTTATAGGAATTTGTTTTTAATCGAGAGAAATAAATTTAGATACAAGAGAGGCATGTCACCAAATTAGCCAACCTGCCATCCCAATATTTATTTTATTTCCTGGTAGTTACATTTTTTTCTCAGTTTTGTAGCGCTCCGAATTCTCGTTGAACAACTTTCTTTTGGCAATGTAAGCATGTG 5 1 3' arm Solanum_tuberosum mirnest 100 peu-MIR2911 1e-41 -70.9 (((...((...)).)))...(((((((((....(((((((((((.((((((.((((((..(((((....)))))..)))))).)))))))).))))).))))....)))))))))..((((((....)))))).. (-70.9)