mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCTC GGGATGTTGTTTGGCTCGACA TTGTGTGTGGTGAGTTTGAGGGGGATGTTGTTTGGCTCGACACAATTACTCTCTTGTATGTGTTTATTTATTCGTCATCAAGATTGATGTTGATAACGAATAAATTAAACACAACAAGATATGTAAAAAGGGAGTAAAGGCGTCGGACCAGGCTTCATTCCTCTCAAACAATATTCTACTT TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTCTTTCTCAAAGCCTCTCAAAGGCTGAAAAAATAGGGTTAGGGTTTATAGTGTTAGGTATGATGATGATGAAGTAGAAAAGTTTTATATATTGTGTGTGGTGAGTTTGAGGGGGATGTTGTTTGGCTCGACACAATTACTCTCTTGTATGTGTTTATTTATTCGTCATCAAGATTGATGTTGATAACGAATAAATTAAACACAACAAGATATGTAAAAAGGGAGTAAAGGCGTCGGACCAGGCTTCATTCCTCTCAAACAATATTCTACTTCTACACAAAAACACTTGTAAATTTTTTGTCTTGACTTTTTTTTTAATTATGGTTTTTGTAATGTTTGTTCACCAAAAATAAAATTAATCTTGTTAATGGGGTTGTTGTCTAGATTATGTAAAAAAAATTGTTTTTTTTTTTGCAGGTGTGTTTGGTCGGTTTTTCTCTACCAAGCTAGGGTTTTCTTCCAAGAAAAAAACATGAAAATTATTACATATATATGCCCTTGTAATTTTTTTTTCTTTTTTGTACTAGATTTAATTTTTATCACCTTGAAATTAAGTCACTGATCTTAATGTTAGAGAAGGTGCTGTTTGTTTTCCAGGGAGGGTTAGACACAGAGATTATGTATTTCGGTAGCTAATTAAAAATTATGGTGACAAATGTACTCTTTTA 3 0 3' arm Solanum_tuberosum mirnest mir-166 0.0000002 zma-MIR166m 0.000000009 -64.3 ....(((.((((.((((((((((((((..((((((.(((((....((((((((((...(((((((((((((((((.(((((........))))).))))))))).))))))))(((.....)))...))))))))))....))))).))))))..))))))))))))))..)))).))).. (-64.3)