mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGGATGTTGTTTGGCTCGACA TCGGACCAGGCTTCATTCCTC ATTGTGTGTGGTGAGTTTGAGGGGGATGTTGTTTGGCTCGACACAATTACTCTCTTGTATGTGTTTATTTATTCGTCATCAAGATTGATGTTGATAACGAATAAATTAAACACAACAAGATATGTAAAAAGGGAGTAAAGGCGTCGGACCAGGCTTCATTCCTCTCAAACAATATTCTACTTC TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTCTTTCTCAAAGCCTCTCAAAGGCTGAAAAAATAGGGTTAGGGTTTATAGTGTTAGGTATGATGATGATGAAGTAGAAAAGTTTTATATATTGTGTGTGGTGAGTTTGAGGGGGATGTTGTTTGGCTCGACACAATTACTCTCTTGTATGTGTTTATTTATTCGTCATCAAGATTGATGTTGATAACGAATAAATTAAACACAACAAGATATGTAAAAAGGGAGTAAAGGCGTCGGACCAGGCTTCATTCCTCTCAAACAATATTCTACTTCTACACAAAAACACTTGTAAATTTTTTGTCTTGACTTTTTTTTTAATTATGGTTTTTGTAATGTTTGTTCACCAAAAATAAAATTAATCTTGTTAATGGGGTTGTTGTCTAGATTATGTAAAAAAAATTGTTTTTTTTTTTGCAGGTGTGTTTGGTCGGTTTTTCTCTACCAAGCTAGGGTTTTCTTCCAAGAAAAAAACATGAAAATTATTACATATATATGCCCTTGTAATTTTTTTTTCTTTTTTGTACTAGATTTAATTTTTATCACCTTGAAATTAAGTCACTGATCTTAATGTTAGAGAAGGTGCTGTTTGTTTTCCAGGGAGGGTTAGACACAGAGATTATGTATTTCGGTAGCTAATTAAAAATTATGGTGACAAATGTACTCTTTTA 4 0 5' arm Solanum_tuberosum mirnest mir-166 0.0000002 zma-MIR166m 0.00000001 -64.3 .....(((.((((.((((((((((((((..((((((.(((((....((((((((((...(((((((((((((((((.(((((........))))).))))))))).))))))))(((.....)))...))))))))))....))))).))))))..))))))))))))))..)))).)))... (-64.3)