mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCCGCCTTGCATCAACTGAAT TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAC CGGCCTCTCATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGACCTACCTCGCCGGCAACAATGGCGGTAGCTGACGGCGACGCCAGCGTACCGGTAAAAACTAATTTTTTACATGTTGTCTGTGGCGTAGTTTGGGTCCCGCCTTGCATCAACTGAATAGGAGACTGCG CGGCCTCTCATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGACCTACCTCGCCGGCAACAATGGCGGTAGCTGACGGCGACGCCAGCGTACCGGTAAAAACTAATTTTTTACATGTTGTCTGTGGCGTAGTTTGGGTCCCGCCTTGCATCAACTGAATAGGAGACTGCGGTGAATTTTGTTTCGACGAAATCAGCTTTGTTATGGATCGATCTAATATCTACAGCTTGTTTTACATGAGGTTTGAATTTGATGTTGATCTATTTGATTTGTTTTTGTTGTATTTCGATTGAATTTAGCTGGATCTAACTTTGTTAATTGCGCAGCTTGTAATTCCTGTATATCTCTATTTGTTCGTTGGATCTAAGATTTTGAAATTTCGATGCTGTTAGTGAAATAGAGAAGCCTAATTTTAATGAAAACTGTTTAATTTTGTATGATTTAGATAATTTTTAATTATGCTAGAAGCTTTCTAGTTTTCATTCTGCTTTAGGAGGACATAGTAGCTTAAAGATTCGATTTTTTGTTTAAATATTTGTTACATGTAGTAGATCAATTTCCGAGAAGTTTAGTGCTGTTGTTTTTTCCATAGAAATTGAATAGTGCAGACAATTCGTTAAGAAGGAAGAGTGCAGACATAGTAGCTTAAAGATTCGATTTTTGACGAAGGCAATCAAAAACTTGTTTAAATATTTGTTACACTATAGTAGATCAACTTTAGAGAAGTTTAGTGCTGTTGTTTTTGCCATGGAAATTGAATAATGCAGACAATTCGTTAAGAAGGAAGAGTTTTCCGTCTTTGAATCTTTCATTTGATGCTAGTGTTAATTTTTCCATGTTTGTTGCACTTCAGTGTTATATTAGGACTGAGGTTGTATATGACAATCATTTTTCAATTTTTAGTTACAAGAAAGAATTTTCTGAGGAAAACATTTTTCACCGAAAGAAAGAAAATGACTTATTTGTAGGATAAAGTTCATTCCTTTTATATCA 2 0 3' arm Solanum_tuberosum mirnest MIR168 0.000002 crt-MIR168 0.0000001 -68.3 (((.((((.(((((.((((((((((.((((((((((..(((((((((((....(((((((((.((....)).)))).)))))(((((((.....))))))).)))))))...))))..))..)))))))).)))))))))).))))).)))).))).. (-68.3)