mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAATCTTGATGATGCTGCAT GTAGCATCATCAAGATTCATA AAACAATTAACAACAGTTGTTGTTTGCAGATGTAGCATCATCAAGATTCATACATGAAAATTAAGAGGCAAGGTTATATATGTAGCTTTAATTGAAATGAAAAATATAATATATCATGACCATCGTCTATTTATTTTAAAGTGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCAATAAATAACTATCAGTGACAGAG GAAAATAGGGTTTCTGAATTTGAATCAGGCTTATCGATCGATCAAACAATTAACAACAGTTGTTGTTTGCAGATGTAGCATCATCAAGATTCATACATGAAAATTAAGAGGCAAGGTTATATATGTAGCTTTAATTGAAATGAAAAATATAATATATCATGACCATCGTCTATTTATTTTAAAGTGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCAATAAATAACTATCAGTGACAGAGTTAGGATTTTTAAGGGTTTCTAATATCCAATAGGGTTTTGTATATAAAGGGGTTCGGATGAATCTCTTCCGCCTCCGCTCTAAACTAATTATGAGCTGTGGAGGCAGAATTTTGAAAAATTCAACATCTATTATATATATATATATAACACAATATTTTCTTGACTTTTCCATATCATCCTATTTGATTTTTTTGGTGAAATGAACCCCTTTCGTCCCTCTAGCTTCGCCCCGTCACTCTCTAAGCAAAGTAAGTAGTACGGATGCTCAGTTCATTTGTACCTGGAGATAGATGATTAAATGGATTTAATTTTCCTTTATTTTATTTTACTGTATTTTTCAGTACTTTATAGT 1 0 3' arm Solanum_tuberosum mirnest mir-172 0.0000000000008 sly-MIR172b 8e-59 -56.8 ..............(((((((..((((.(((((((((((((((((((((.(((...(((((.((.((((..((((((((((((.........................)))))).))))))...)))).)).)))))...))).))))))))))))))))))))).))))..)))))))............. (-56.8)