mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTAATAAAGAGAGCTAAAAG TTTTCTTTCTTAGTCAATCA ATTCTGCAACCTTTTTCTTTCTTAGTCAATCAGGAAAATTATTTTATTTAATAAAGAGAGCTAAAAGCATTGAAGT GCCACAGAGACACCACCCAGACATCATTGCAGCGTGGATGCTTCAACACCTTTTAAAAATGTGTGGGAACGTGTTCCACAAATTCACACTTTAAACCTGCAAATCTGGACTTTGGGTTTGAATACAAAAATGCAATTCGAACCTTAATGGAAACAAATCATTGAAAAAAATTTTTAAAAGTCAAAACTACATTAGATCAACAAGAATTCTGCAACCTTTTTCTTTCTTAGTCAATCAGGAAAATTATTTTATTTAATAAAGAGAGCTAAAAGCATTGAAGTTGTAGAGCTATGGTTTTTGTATGTTTTGGTTTGCTACCTTAATTTTTTATATTTTTATAAGGTTTTTAATATTCACATTTCACATACATCGGACTTTGCTCCCATGGAATAGCCCTTGTCCTCAAAGTTGTTTGGGTACATGTTCCTATGTTCCAGCATATCCACATTCCCAGCTGATGTGAAACATAGGTTATTTGCAAATGCAAACATCAGCTTCTTAGAAGGGTTTTCCAGGCCAAAGTCCCACCATACCGGCCTATACTGAAATGTCACATTAGTGTTGAACAAAATAAAAAACATTAACATAGAGGTGTGTCTTAAGCGATGTTTATGCTGCAATGGATGATAGATTAACAATAATGAGTAACACTCCGACCGAATATTCTAGTGGGTGTTTAGGGTTGCAACAATTAAAAAACAATAAAAAAAGATAATAGATATTAATTTGAAGGATTTCACTTTCAGCAAATGAAAATT 4 1 3' arm Gnetum_gnemon mirnest 100 100 -9.1 .(((......(((((.(((((((.((.((....((((....))))..)).)).)))))))..)))))....))).. (-9.1)