mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAAGCTGCCAGCATGATCTG GGTCATCTAGCAGCTTCAAT GTTTCGTGTTTTTGTATCTGTATGTTGGTTTTTGAGAGGTTAAAGCTGCCAGCATGATCTGGTAAGAACAAAATCCAATTATTTTTCATCTATATTTTCTTACAAAGAAGAAATGAATTTAAAGTTGATTTTTTTAAAAAAAATATAAATTCTTGAGGTTTTTAATTTCCTTCTTTTGGATTTGAAAAAAGAAAATTAAATTTTGTAAGGATTTATTTCTTTGAAGAAAATATAGATAGATAGTTTTGGTTCCATCAGGTCATCTAGCAGCTTCAATCACTCACCAACAATACACACAAAGGAAGAAAAAAAAA TTCGGTCCTTAAGTTCAGAATACATAAACTTCAAATCCTGATTCTGTTTCGTGTTTTTGTATCTGTATGTTGGTTTTTGAGAGGTTAAAGCTGCCAGCATGATCTGGTAAGAACAAAATCCAATTATTTTTCATCTATATTTTCTTACAAAGAAGAAATGAATTTAAAGTTGATTTTTTTAAAAAAAATATAAATTCTTGAGGTTTTTAATTTCCTTCTTTTGGATTTGAAAAAAGAAAATTAAATTTTGTAAGGATTTATTTCTTTGAAGAAAATATAGATAGATAGTTTTGGTTCCATCAGGTCATCTAGCAGCTTCAATCACTCACCAACAATACACACAAAGGAAGAAAAAAAAAGAGCATCTAATTTTCACTTAATTCTCAATCACATTCATTTATCTCAGGTAATTATTTCTCTAATCTTTTTATTTCATGTAATTTTATTTTTTACTGTTGATTATCTTCTTCCCTTTTTTTTACTCTTCTCAAAT 2 1 5' arm Solanum_tuberosum mirnest MIR167_1 0.00000000008 gma-MIR167c 0.0000000003 -86.3 .((((...(((((((...(((((((((((....(((.((((.(((((((.((.((((((((((..((((..((...((((((((...((((((((((((((.((((((((.(((.........))).(((((((...))))))).((((((((((.((..((((((((.(((.((((......)))).))).))))))))..)).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))).)))))))))))).))))))).)))).))))))))).))))).)))))))..))))...... (-86.3)