mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCATCATCAAGATTCTCAT GTGAATCTTGATGGTGCTGCA ATTTGCCAATGCAGCATCATCAAGATTCTCATGTATTCAAAAATTGGGCATATTTCATTTCATAGTCCATATTTTCTATGTGAATCTTGATGGTGCTGCACTAGCAAG AAATTGTTTTAATAAAAGTAATTCTTAATTTATGTATTATAATTGATTTCACAAAAAAAAAAAATACATATTAACAAGAAAATATACATAAAAAAACTTCTTCCTAACTCCTTCCTTTTGCAAGCAACTATTCTACTATGTGCTGCTCTCTATAGCTATATTTTAGCCACGAATTCTTCACCTTCTGCTTCAAAAACCTATATTTATTTGAAATTGCATCGTTAGGATTATCAAGAAAATTAGTTATGCATCTTTAAATATCACACAAATTTTTAGAAGAAATCGCGAAGTGAAGAAACATAATTTAAGAACTTAATAATTAATTCATGAGGTATTTTATATCAAGAAAACTACAACATATTAACCAAAATAAGTAATTAATAATCAATAATCATATAGAATTAATCATAGTCAGAAAGAAAACTTACCAAATAAAGATAAATTGCCCAAATTTTCTTGTAGAATTAAAGAATCAAGTCATCAATTTGCCAATGCAGCATCATCAAGATTCTCATGTATTCAAAAATTGGGCATATTTCATTTCATAGTCCATATTTTCTATGTGAATCTTGATGGTGCTGCACTAGCAAGCAACAACTGTATGTTGAGGCAAAGCTACAATATCAAAATTAAATTCAATAGCATAGTCAGAAAATTCACTGACTTTAAATTTTGAATTTGTACGTGTTAAAGTATGTCATCAATCATACATACGTTTAATCCATCCTCCATAAGATTGGGA 1 0 5' arm Solanum_tuberosum mirnest mir-172 0.0000004 bdi-MIR172a 0.00000008 -38.9 ..((((...(((((((((((((((((((.((((.....((((..(((((...............)))))..)))).)))).)))))))))))))))))))...)))). (-38.9)