mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAATCTTGATGGTGCTGCAC GCAGCATCATCAAGATTCTCA GAATTAAAGAATCAAGTCATCAATTTGCCAATGCAGCATCATCAAGATTCTCATGTATTCAAAAATTGGGCATATTTCATTTCATAGTCCATATTTTCTATGTGAATCTTGATGGTGCTGCACTAGCAAGCAACAACTGTATGTTGAGGCAA AAATTGTTTTAATAAAAGTAATTCTTAATTTATGTATTATAATTGATTTCACAAAAAAAAAAAATACATATTAACAAGAAAATATACATAAAAAAACTTCTTCCTAACTCCTTCCTTTTGCAAGCAACTATTCTACTATGTGCTGCTCTCTATAGCTATATTTTAGCCACGAATTCTTCACCTTCTGCTTCAAAAACCTATATTTATTTGAAATTGCATCGTTAGGATTATCAAGAAAATTAGTTATGCATCTTTAAATATCACACAAATTTTTAGAAGAAATCGCGAAGTGAAGAAACATAATTTAAGAACTTAATAATTAATTCATGAGGTATTTTATATCAAGAAAACTACAACATATTAACCAAAATAAGTAATTAATAATCAATAATCATATAGAATTAATCATAGTCAGAAAGAAAACTTACCAAATAAAGATAAATTGCCCAAATTTTCTTGTAGAATTAAAGAATCAAGTCATCAATTTGCCAATGCAGCATCATCAAGATTCTCATGTATTCAAAAATTGGGCATATTTCATTTCATAGTCCATATTTTCTATGTGAATCTTGATGGTGCTGCACTAGCAAGCAACAACTGTATGTTGAGGCAAAGCTACAATATCAAAATTAAATTCAATAGCATAGTCAGAAAATTCACTGACTTTAAATTTTGAATTTGTACGTGTTAAAGTATGTCATCAATCATACATACGTTTAATCCATCCTCCATAAGATTGGGA 2 0 3' arm Solanum_tuberosum mirnest mir-172 0.0000006 bdi-MIR172a 0.0000001 -47.1 ........((......))......(((((..(((((((((((((((((((.((((.....((((..(((((...............)))))..)))).)))).))))))))))))))))))).(((((.(((.....))).))))).))))) (-47.1)