mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACAGCTTTCTTGAACTT GTCCAAGAAAGCTGTGGGAAA TAGTCATGCTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTCTTCTTGCTAAATTTTGATCTCTAAATTGATAATTTTGAGATGAAATTTTTGAAGCTATGAAAGTCCAAGAAAGCTGTGGGAAAAGATGGCA CTCAAATTCTTATCTTTTTTTAAAAAAACTTGTTCAATTTTTCCTTATATTAAAACTTTAAGAATTGACAAGTTTTACGCTGGTTGTTGATCGATGACGATGACTAAGTCCTAGTCATGCTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTCTTCTTGCTAAATTTTGATCTCTAAATTGATAATTTTGAGATGAAATTTTTGAAGCTATGAAAGTCCAAGAAAGCTGTGGGAAAAGATGGCAAGCTTTGGACTTATTTTTTACATTTTCCTTCCTATGGAGTACACTTGAAGATTATCAAGCCAAATTTTCATGGATATATGCAAGTGAGTTGCAAAAATGCTGTCACCATAAAGTTTTTATTGAATAATTGTTGTACAACACAATTATGTGTATTAAACTATAGTACCATGCAAAGAATTAAACACCAAAGTTAGCTAGCTACTAGCGGAGATGGAGTCAGAGTATTGGGTTTATTCGAATTCTCTTTATTAAAAAATTAATTAAATTTTTAAAAGTTTTTTTCTTCAAATATATATTATCTCAACTATGTGGTGTGTATAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACATTGGGGTG 1 0 5' arm Solanum_tuberosum mirnest MIR396 0.000000000002 vvi-MIR396b 0.000000000007 -45.4 ..(((((..((((((((((((((((((.((((..((..((((((.(((.(((((.(((((...))))).))))).))).)))...)))...)))))).))))))))))))))))))..))))). (-45.4)