mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTTATCTGCATTTGCACCTG GGTGCTCATGCAGACAAAAAT TTCTGTAAACAAGAGACATATTTTTATCTGCATTTGCACCTGCACCTTAGTGAACGAATTTGTTAGCATATAATTCGTGCAGAAAGGTGTTGGTGCTCATGCAGACAAAAATGGTATCTTGGCCTTCCAT GCTTGATATCGAATTCCATCAGGCAGAGGACGAGACAGAACGCAGAAAAAAAGCCCTATGACCCGATCGGCGTCCGGCGGGTCTCTTCACCGGCACGGTAATCGGAACTTTCAACACTCCTTCCGTCAACAATACTTTTGTGCTTTCACAGAACCATGAAGTGATGCATAAATCTAGCCTCAAAGACGCCACACATAGTTTGGAATCATGTGAATATAGAACATAACACGTTTTGAGCACATCCAAGGCTAACACCGTCATCAACTCTTGGAATGTCATCTAAATTGTCGATTCTTGTGTGGGATACTTGCAGTCCCAAGTCATGATGGATATGTTAGTGAGTGTCTATTTCAATGTGTTTCCTAAGACCAGCAATTACTACTTCATTAGAATTAGTAAGACTTATTTCTGTAAACAAGAGACATATTTTTATCTGCATTTGCACCTGCACCTTAGTGAACGAATTTGTTAGCATATAATTCGTGCAGAAAGGTGTTGGTGCTCATGCAGACAAAAATGGTATCTTGGCCTTCCATTGGTTTCCCAATCTTAACCTTTCGAAGTTGTTGCACTAAGTGCAAGCATCGGTTGAACTCGTGTTGATGGGAGATAGCATATTCAACGAATTAATCGAGGTGTTGACTCGCAACGAGGCAGACCCTTCTATCGAGATGATAGAGGATATCAATGACATTGTGTT 4 0 5' arm Solanum_tuberosum mirnest MIR530 0.0000005 ptc-MIR530a 0.00000003 -46.4 .........(((((.((.(((((((.(((((((..(((((.(((((((..((.(((((((...((...)).))))))).))..))))))).)))))..))))))).))))))))).)))))......... (-46.4)