mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTACTCCCTCCGTCCCATTTT TATGGGACAGTGGGAGTATTT GAGATCATTTAACAAAATTTTCTACTCCCTCCGTCCCATTTTATGTGGCAACCTTTCCTTTTTAGTCCGTCCCAAAAAGAATGTTATCTTACTATAATTAGCAACAATTTAACTTTAAAATACCCATTTTACCTTTAATGAAATGATTTTCAACCACACAAATATCTAAGAATTGTTTTAGACCACAAGTTCCAAAATTCTTCCTTTTTTTCTTAAACACCGTGTCAAGTCAAATGGTGCCACAAAATATGGGACAGTGGGAGTATTTGTTGTTCTTTGCAAGTTG GGAATGGTTGTAGCTCTAGATGATGGTCAGATTTTTTGGTTCACAGAGATCATTTAACAAAATTTTCTACTCCCTCCGTCCCATTTTATGTGGCAACCTTTCCTTTTTAGTCCGTCCCAAAAAGAATGTTATCTTACTATAATTAGCAACAATTTAACTTTAAAATACCCATTTTACCTTTAATGAAATGATTTTCAACCACACAAATATCTAAGAATTGTTTTAGACCACAAGTTCCAAAATTCTTCCTTTTTTTCTTAAACACCGTGTCAAGTCAAATGGTGCCACAAAATATGGGACAGTGGGAGTATTTGTTGTTCTTTGCAAGTTGCAAGCAACATCAAAGTTCTGAGGTGTTGTGCTATACCTCCCTACAACTCTACGAGAATGGGTAGTTCTTTGTCTCCATCTTTTAGAATGAATGAAAACTGCCACGAGGCACAAGATTGATTTGGAAAAGCTAAAGTGGATGTTGCGGTTTATCTTGTTAATTGTGTCACCTAAACCATTTGTTGTATATTATTACCAGCAATTGACAAGTTTTCATAGTTTTTACTGATTCTCCAAATAAATATGCTTGCTAAATTCATGTTTTTGTATATTTTTGGAAGCGCTAACATACCCCAACTAGTAGAGAGGACTGGATT 5 0 5' arm Solanum_tuberosum mirnest MIR1122 0.00002 osa-MIR812h 0.0002 -47.9 ((((.....(((((((......(((((((...(((((((.((.(((((((.((....((((((..........))))))..(((((..(((...))).)))))...((((.((((.(((((...(((((((.......)))))))))))).....((((.......((((((.......(((................)))........))))))......)))).)))).))))))))))))).)).)))))))...)))))))))))))).))))......... (-47.9)