mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATGGGACGGAGGGAGTACTT CTACTCCCTCCGTCCCATTTT ATTTATGTATATTCTACTCCCTCCGTCCCATTTTATGTGGCACCATTTCCTTTTTGGTCAGTCCCAAAAAGAATGTCACATTTTCTTATATGGTAAGTATTTAAAGGTACAATTCCTCTTTTACCCTTGTTGGTTCCACTTAATCTTAAAGAAAGTATTCCAATACATTTATGAGGAGAGAGAAAAATGAGTCTACTTTTTAATATGACTATTTTTTGAAGGGACAATTTGGTAAACATTTCAAAGTCTTCATTTATTTCTTAAACTCCGTGCCCGGTCAAATGTTGCCACATAAAATGGGACGGAGGGAGTACTTAATTTGTTTC GATCTATAAGAAAATACAGGATGGAGTGTTTGATGTATCAAACGAGGTATACCTTATCCTGACTATTTATGTATATTCTACTCCCTCCGTCCCATTTTATGTGGCACCATTTCCTTTTTGGTCAGTCCCAAAAAGAATGTCACATTTTCTTATATGGTAAGTATTTAAAGGTACAATTCCTCTTTTACCCTTGTTGGTTCCACTTAATCTTAAAGAAAGTATTCCAATACATTTATGAGGAGAGAGAAAAATGAGTCTACTTTTTAATATGACTATTTTTTGAAGGGACAATTTGGTAAACATTTCAAAGTCTTCATTTATTTCTTAAACTCCGTGCCCGGTCAAATGTTGCCACATAAAATGGGACGGAGGGAGTACTTAATTTGTTTCGGTGTGGACTGCAAATGTTGTTACTTGTTAGAGAAGACTTAACTTCTGCCAGAATCTAATATATGAAAAGAAACGATGTAAGAAAATTAGGGAAAAGTAGAGAAGAAATAGGATCAGCATACCTTGAAATAGTGATTGTGTTATGTTTCCTTCTGATCCTATCACAACATACTTATCGAGGTAGTCCAATATTTCCAAACGTATTGCCTAGTCCAATGTCTTCTCCTTTTTCTTTCCTTCTGCCCAACATAAATGCTGCTATTGCTTCTGGGATCTGTTTATGACCCCTAAAAAAACTTTTATGTTGGGGAGTTGAGACCAGA 3 0 3' arm Solanum_tuberosum mirnest MIR1122 0.00002 osa-MIR812h 0.00007 -88.404 ..............((((((((((((((((((((((((((((.(((((.((((((((......))))))))..((((....((((....(((((..(((((.(((((((..((((.((((((.((..((((((....((((..(((...)))))))...))))))((....)).)).)))))).....)))).))))))).))))).))))).....)))).))))(((.((((....................................)))).))).))))).))))))))))))))))))))))))))))............. (-88.404)