mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATAGATGACCATCAACAAACA TTTGTTGATGTTCATCTAATC TTAACATGAAGTGATGAAGATGTTTGTTGATGTTCATCTAATCATGGCATATTAATGGTTGCAAAAACTATGCCAAATGATATGATGAATAGATGACCATCAACAAACAAATTCATAACTACACAATT GCTCGAGCGGCCGCTCTCAAATTGAGTCCCATCATATTCTAGTAATGCAATAATTGCGTATTAGTAATTAGTAGTCGACTAACTACTATTCAACACTTTAGTAATTAGCGCGGACAAATTCAGTAGCTTAATTAAGATTAGTAATTGGAGAAGAGAACTGGATGAGGTCTTTGCTATTCTCAAATTGAGTCACGTCTTTTTCTGGTAATACAATAATTACGTCAATCCCATCTCCACTTAGATTATCCATAAACATGCAGGTGTTTGCAGTCCCATATACTGGAATTGTTACCCTGCTTGGCTTTCCCCATCCAAAATCCAAATTATTCAATGGGCAATTGCAAACACTGCTACTTCGATACAGCGGCCGCTTAGCAAAATCACGACCATTTACTAAGATATAAGAAAAAAACAATACAAGCTTGAGTTATGCGATGCTGGTGGAAGGAAACAAATATCCAATAACCAATGAAATTAGTTAAGGTGCAGAAGCCGGCACAAACACATCGACAGTAATAGTTAATGATCAAATAATCTTGGGATTAACATGAAGTGATGAAGATGTTTGTTGATGTTCATCTAATCATGGCATATTAATGGTTGCAAAAACTATGCCAAATGATATGATGAATAGATGACCATCAACAAACAAATTCATAACTACACAATTTTAGCATATATATACCTATATATACATGGA 2 0 3' arm Solanum_tuberosum mirnest 100 csi-MIR827 0.000006 -42.3 ......((.(((.(((((..((((((((((((.(((((((.((((..(((((((((((((.....))))))......))))))))))).))))))).))))))))))))..))))).))).))..... (-42.3)