mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATTGGGACAGAGGGAGTACT TACTCCCTCCGTCCAATTTA GTGTTTAAACAATACTCCCTCCGTCCAATTTAAGTGTCTTAGTTTGACTGAACACGGAATTTAAGAAGTAAAGAAAGACTTTAGAATCTTGTGGTCCTTAAATTAAAGATGTGTGTAGTCATTTAATTGTTATGCTTAAACTTGCCATGTAATAATTGGAATTGAAAAAGTTACTAAATATAGAAAGAGACGCTCTTTTTGGGACAAACCAAAAATGAAAGTATAAGACACTTAAATTGGGACAGAGGGAGTACTTCTTTATGA GGGAACCGATGCATCTCTATTGAATAAAGAGACAAAAAATAGTTCTAAAATTCACCCAGAAGAGTTCCACTATGAATTGGAAATGTTACATGCATACTGCACTGCCTTTTTGTGTTTAAACAATACTCCCTCCGTCCAATTTAAGTGTCTTAGTTTGACTGAACACGGAATTTAAGAAGTAAAGAAAGACTTTAGAATCTTGTGGTCCTTAAATTAAAGATGTGTGTAGTCATTTAATTGTTATGCTTAAACTTGCCATGTAATAATTGGAATTGAAAAAGTTACTAAATATAGAAAGAGACGCTCTTTTTGGGACAAACCAAAAATGAAAGTATAAGACACTTAAATTGGGACAGAGGGAGTACTTCTTTATGAGAGTGATTTTTATTTCTACCGATCTGTCTTAACATTACTTGATCCTCTTAGTTGTTTGCGCTCAATTCATAATTAGACAGAAATGGAAAGGAAACAAGACAAGATGGATTGCTTGCATTGTATGGGGAAATTGAGAAAGCAGTAGAGATATATTCTTCACTTGAAGGTAGTAGAACCATTACTATTATGATTGATGACATCTCCCTTATTGAAGTGGCGGCTAATGGTTTATCAAATCACGTGTTGGATTTTCTACACTACTGCTACACTCTGAAAGCAAATATGGCTGTTCCTTTGGTACTCTTAATCACGAGGATATCTATT 4 1 3' arm Solanum_tuberosum mirnest MIR1122 0.001 100 -68.1 ((......))..(((((((((..((((((((((((((((((..(((((((.(((((.((((((((.....((((............))))......)))))))).....))))).))))).((((((((((((((........))...)))))))))))).((....))(((.((..........)).)))..(((((((((......))))))).)).))..))))))))))))))))))...)))))))))........... (-68.1)